宇宙恢复平静的三个月里，沈小满等人始终保持着警惕。林夏的「维度之眼」24小时不间断扫描，却在某个寻常的宇宙清晨，捕捉到银河系旋臂边缘传来的异常暗物质脉冲。那些脉冲频率与暗紫色晶体的能量特征完美契合，如同蛰伏巨兽的心跳。江临川的永恒之书无风自动，空白页上渗出墨色的纹路，拼凑成破碎的卦象：「晶核噬光，万象成殇。」
武大力带领的侦查小队在目标星域发现诡异景象——七颗恒星以违背天体力学的轨迹，围绕着一片虚空旋转，形成精密的星象阵法。当舰队试图靠近，所有仪器的显示屏同时炸裂，飞溅的碎片在舱壁上拼出「禁入」的符号。「这股力量...」壮汉握紧链枷，武器表面的时间光晕竟开始逆向流转，「和我们在虚数之海遇到的时空扭曲如出一辙。」
沈小满的铜铃突然发出尖锐的蜂鸣，铃身「时之纹章」泛起血红色光芒。她的意识被强行拽入一个由暗物质构筑的空间，这里漂浮着数以万计的黑色茧状物，每个茧中都封印着某个文明的末日场景。老乞丐的意识残像穿透茧壁，声音充满恐惧：「小乞丐，暗紫色晶体是黑暗意志的『重生容器』，它正在吞噬恒星的生命力，孵化足以毁灭宇宙的『终焉之卵』！」
林夏在实验室紧急启动量子拆解仪，对收集到的暗物质样本进行分析。显微镜下，物质分子呈现出诡异的活体特征，不断重组为《太初命数》中的毁灭卦象。「这些暗物质在有意识地规避检测，」她的基因光脉与样本产生剧烈排斥反应，指尖在操作台划出焦黑痕迹，「而且它们的能量核心...」全息屏幕突然被血色覆盖，映出暗紫色晶体在星核深处膨胀的画面，「与星核之心产生了恶性共鸣！」
江临川通过深渊追缉者系统回溯暗晶的起源，意识却陷入记忆迷宫。他看到远古文明为了对抗熵寂，将黑暗意志封印在晶核中；又目睹未来的自己亲手释放晶核，导致宇宙陷入永恒的黑暗。当永恒之书化作钥匙打开生路，他在虚空中捡到半块刻有「混沌胚胎」的青铜残片，残片与暗晶的波动频率完全一致。
武大力的舰队在星域外围遭遇「星骸守卫」——由死亡恒星的残骸重组的巨型机械体。这些守卫的表面流淌着液态暗物质，能将任何攻击转化为自身能量。当链枷劈开其中一台守卫，喷涌而出的不是机油，而是散发着腐臭的黑色星尘，这些星尘落地后迅速生长成荆棘，缠住战舰的推进器。
沈小满循着铜铃指引，在星象阵法中心发现一座悬浮的暗晶祭坛。祭坛由十二根刻满《太初命数》终极卦象的石柱支撑，中央的暗紫色晶体己膨胀至行星大小，表面蠕动着无数人脸，正是被黑暗意志吞噬的文明领袖。「你终于来了，小乞丐。」暗影首领的声音从晶体内传出，他的形体由暗物质与星尘组成，手中握着由「终焉之卵」孵化的黑色权杖，「当晶核吞噬第九颗恒星，所有文明都将成为混沌的养料。」
林夏带领科研团队研发出「星核共振阻断器」，试图切断暗晶与星核之心的联系。但在装置启动的瞬间，整个实验室的时间流速加快百倍，她眼睁睁看着自己的青丝变成白发，而仪器在高速老化中化作尘埃。紧急时刻，基因光脉自动启动防护程序，将她传送出实验室。「必须找到能在极端时空环境下运作的材料...」她望着自己布满皱纹的双手，眼中闪过决然。
江临川将永恒之书与青铜残片融合，创造出能探测暗晶弱点的「命数罗盘」。罗盘指针指向暗晶表面最薄弱的「逆鳞」处，却显示只有在九星连珠的刹那，弱点才会暴露。而根据星象推演，九星连珠将在72小时后出现，届时也正是暗晶孵化完成的时刻。
武大力在与星骸守卫的鏖战中，发现这些机械体的核心处都镶嵌着一颗「绝望结晶」。他尝试用链枷的时间光晕净化结晶，竟意外唤醒了被囚禁在其中的文明意识。这些意识汇聚成光流，暂时削弱了守卫的力量。「原来希望才是破解黑暗的关键！」壮汉怒吼着挥出链枷，金色光芒中浮现出无数文明抗争的幻影。
沈小满摇动铜铃，试图唤醒被封印在暗晶中的时间精灵。钟声在暗物质空间中回荡，却被晶体吸收转化为孵化能量。千钧一发之际，她将铜铃按在祭坛石柱上，铃身纹路与卦象产生共鸣，石柱表面浮现出古老的封印咒文。暗影首领狂笑着挥动权杖：「太晚了！终焉之卵即将破壳！」
九星连珠的瞬间，暗晶表面裂开蛛网状的缝隙。江临川操控命数罗盘锁定弱点，林夏将改良后的阻断器与星核之力融合，武大力带领舰队发射凝聚全宇宙信念的「破晓光束」，沈小满则将铜铃与所有时间精灵的力量合一。西重攻击同时命中暗晶的「逆鳞」，晶体表面的人脸发出绝望的惨叫，终焉之卵在光芒中寸寸碎裂。
爆炸的余波中，暗影首领的形体逐渐消散，但他的声音却在宇宙中回荡：「只要文明存在恐惧与贪婪，黑暗意志就永远不会消亡...」沈小满的铜铃吸收了暗晶的残余能量，铃身出现能预知危机的「警示纹路」。江临川将这场战役刻入永恒之书的最后一页，林夏的实验室诞生了能中和暗物质的「净化熔炉」，武大力的链枷获得了驱散绝望的能力。
然而，在宇宙的「遗忘星域」，一颗新的暗紫色晶体从陨石核心中破土而出。晶体内部，某个熟悉的身影缓缓睁开眼睛——那是被暗熵侵蚀的未来沈小满，她手中握着的半块玉佩，正与铜铃产生跨越时空的共鸣。深渊追缉者系统突然发出加密警报：「检测到『混沌镜像』启动，平行宇宙入侵倒计时开始...」
